R Language
E / S pour les tables de base de données

Remarques

Lecture de données à partir de bases de données MySQL

Général

En utilisant le package RMySQL, nous pouvons facilement interroger les bases de données MySQL ainsi que MariaDB et stocker le résultat dans un cadre de données R:

library(RMySQL)

mydb <- dbConnect(MySQL(), user='user', password='password', dbname='dbname',host='127.0.0.1')

queryString <- "SELECT * FROM table1 t1 JOIN table2 t2 on t1.id=t2.id"
query <- dbSendQuery(mydb, queryString)
data <- fetch(query, n=-1) # n=-1 to return all results

Utiliser des limites

Il est également possible de définir une limite, par exemple obtenir uniquement les 100 000 premières lignes. Pour ce faire, modifiez simplement la requête SQL en fonction de la limite souhaitée. Le paquet mentionné considérera ces options. Exemple:

queryString <- "SELECT * FROM table1 limit 100000"

Lecture de données à partir de bases de données MongoDB

Pour charger des données d'une base de données MongoDB dans un fichier de données R, utilisez la bibliothèque MongoLite :

# Use MongoLite library:
#install.packages("mongolite")
library(jsonlite)
library(mongolite)
 
# Connect to the database and the desired collection as root:
db <- mongo(collection = "Tweets", db = "TweetCollector", url = "mongodb://USERNAME:PASSWORD@HOSTNAME")

# Read the desired documents i.e. Tweets inside one dataframe:
documents <- db$find(limit = 100000, skip = 0, fields = '{ "_id" : false, "Text" : true }')

Le code se connecte au serveur HOSTNAME tant que USERNAME avec PASSWORD , tente d'ouvrir la base de données TweetCollector et de lire la collection Tweets . La requête essaie de lire le champ, c'est-à-dire le Text colonne.

Le résultat est un cadre de données avec des colonnes en tant que jeu de données généré. Dans le cas de cet exemple, le dataframe contient la colonne Text , par exemple les documents$Text .