R Language
Bibliographie en RMD

Paramètres

Remarques

Spécifier une bibliographie et citer des auteurs

La partie la plus importante de votre fichier RMD est l'en-tête YAML. Pour rédiger un article académique, je suggère d'utiliser des sorties PDF, des sections numérotées et une table des matières (toc).

---
title: "Writing an academic paper in R"
author: "Author"
date: "Date"
output:
  pdf_document:
    number_sections: yes
toc: yes
bibliography: bibliography.bib
---

Dans cet exemple, notre fichier bibliography.bib ressemble à ceci:

@ARTICLE{Meyer2000,  
  AUTHOR="Bernd Meyer",  
  TITLE="A constraint-based framework for diagrammatic reasoning",  
  JOURNAL="Applied Artificial Intelligence",  
  VOLUME= "14",  
  ISSUE = "4",  
  PAGES= "327--344",  
  YEAR=2000  
}

Pour citer un auteur mentionné dans votre fichier .bib, écrivez @ et le bibkey, par exemple Meyer2000 .

# Introduction

`@Meyer2000` results in @Meyer2000.

`@Meyer2000 [p. 328]` results in @Meyer2000 [p. 328]

`[@Meyer2000]` results in [@Meyer2000]

`[-@Meyer2000]` results in [-@Meyer2000]

# Summary

# References

Le rendu du fichier RMD via RStudio (Ctrl + Shift + K) ou via la console rmarkdown::render("<path-to-your-RMD-file">) génère la sortie suivante:

Références en ligne

Si vous n'avez pas de fichier * .bib, vous pouvez utiliser un champ de référence dans les métadonnées YAML du document. Cela devrait inclure un tableau de références codées en YAML, par exemple:

---
title: "Writing an academic paper in R"
author: "Author"
date: "Date"
output:
  pdf_document:
    number_sections: yes
toc: yes
references:
  - id: Meyer2000
    title: A Constraint-Based Framework for Diagrammatic Reasoning
    author:
    - family: Meyer
      given: Bernd
    volume: 14
    issue: 4
    publisher: Applied Artificial Intelligence
    page: 327-344
    type: article-journal
    issued:
      year: 2000
---

# Introduction

`@Meyer2000` results in @Meyer2000.

`@Meyer2000 [p. 328]` results in @Meyer2000 [p. 328]

`[@Meyer2000]` results in [@Meyer2000]

`[-@Meyer2000]` results in [-@Meyer2000]

# Summary

# References

Le rendu de ce fichier donne le même résultat que dans l'exemple "Spécification d'une bibliographie".

Styles de citation

Par défaut, pandoc utilisera un format de date auteur Chicago pour les citations et les références. Pour utiliser un autre style, vous devrez spécifier un fichier de style CSL 1.0 dans le champ de métadonnées CSL. Dans ce qui suit, un style de citation souvent utilisé, le style le plus différent, est présenté (téléchargement sur https://github.com/citation-style-language/styles ). Le fichier de style doit être stocké dans le même répertoire que le fichier RMD OU le chemin absolu du fichier doit être soumis.

Pour utiliser un autre style que celui par défaut, le code suivant est utilisé:

---
title: "Writing an academic paper in R"
author: "Author"
date: "Date"
output:
  pdf_document:
    number_sections: yes
toc: yes
bibliography: bibliography.bib
csl: elsevier-harvard.csl
---

# Introduction

`@Meyer2000` results in @Meyer2000.

`@Meyer2000 [p. 328]` results in @Meyer2000 [p. 328]

`[@Meyer2000]` results in [@Meyer2000]

`[-@Meyer2000]` results in [-@Meyer2000]

# Summary

# Reference

Notez les différences à la sortie de l'exemple "Spécifier une bibliographie et citer des auteurs"