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Parámetros

Parámetro en el encabezado YAML Detalle
toc Tabla de contenido
number_sections numerando las secciones automáticamente
bibliography ruta al archivo bibliográfico
csl ruta al archivo de estilo

Observaciones

  • El propósito de esta documentación es integrar una bibliografía académica en un archivo RMD.

  • Para utilizar la documentación proporcionada anteriormente, debe instalar rmarkdown en R a través de install.packages("rmarkdown") .

  • A veces Rmarkdown elimina los hipervínculos de las citas. La solución para esto es agregar el siguiente código a su encabezado YAML: link-citations: true

  • La bibliografía puede tener cualquiera de estos formatos:

Formato Extensión de archivo
MODS .mods
BibLaTeX .babero
BibTeX .bibtex
RIS .ris
Nota final .enl
EndNote XML .xml
ISI .wos
MEDLINE .medline
Copac .copac
JSON citeproc .json

Especificando una bibliografía y citando autores.

La parte más importante de su archivo RMD es el encabezado YAML. Para escribir un artículo académico, sugiero utilizar la salida en PDF, las secciones numeradas y una tabla de contenido (toc).

---
title: "Writing an academic paper in R"
author: "Author"
date: "Date"
output:
  pdf_document:
    number_sections: yes
toc: yes
bibliography: bibliography.bib
---

En este ejemplo, nuestro archivo bibliography.bib ve así:

@ARTICLE{Meyer2000,  
  AUTHOR="Bernd Meyer",  
  TITLE="A constraint-based framework for diagrammatic reasoning",  
  JOURNAL="Applied Artificial Intelligence",  
  VOLUME= "14",  
  ISSUE = "4",  
  PAGES= "327--344",  
  YEAR=2000  
}

Para citar un autor mencionado en su archivo .bib escriba @ y la tecla Bib, por ejemplo, Meyer2000 .

# Introduction

`@Meyer2000` results in @Meyer2000.

`@Meyer2000 [p. 328]` results in @Meyer2000 [p. 328]

`[@Meyer2000]` results in [@Meyer2000]

`[-@Meyer2000]` results in [-@Meyer2000]

# Summary

# References

La representación del archivo RMD a través de RStudio (Ctrl + Shift + K) o de la consola rmarkdown::render("<path-to-your-RMD-file">) da como resultado el siguiente resultado:

introduzca la descripción de la imagen aquí

Referencias en linea

Si no tiene un archivo * .bib, puede usar un campo de referencias en los metadatos YAML del documento. Esto debería incluir una matriz de referencias codificadas en YAML, por ejemplo:

---
title: "Writing an academic paper in R"
author: "Author"
date: "Date"
output:
  pdf_document:
    number_sections: yes
toc: yes
references:
  - id: Meyer2000
    title: A Constraint-Based Framework for Diagrammatic Reasoning
    author:
    - family: Meyer
      given: Bernd
    volume: 14
    issue: 4
    publisher: Applied Artificial Intelligence
    page: 327-344
    type: article-journal
    issued:
      year: 2000
---

# Introduction

`@Meyer2000` results in @Meyer2000.

`@Meyer2000 [p. 328]` results in @Meyer2000 [p. 328]

`[@Meyer2000]` results in [@Meyer2000]

`[-@Meyer2000]` results in [-@Meyer2000]

# Summary

# References

La representación de este archivo da como resultado el mismo resultado que en el ejemplo "Especificar una bibliografía".

Estilos de citas

De forma predeterminada, pandoc utilizará un formato de fecha de autor de Chicago para citas y referencias. Para usar otro estilo, deberá especificar un archivo de estilo CSL 1.0 en el campo de metadatos csl. A continuación se presenta un estilo de citas de uso frecuente, el estilo elsevier (descarga en https://github.com/citation-style-language/styles ). El archivo de estilo debe almacenarse en el mismo directorio que el archivo RMD O la ruta absoluta al archivo debe enviarse.

Para usar otro estilo que el predeterminado, se usa el siguiente código:

---
title: "Writing an academic paper in R"
author: "Author"
date: "Date"
output:
  pdf_document:
    number_sections: yes
toc: yes
bibliography: bibliography.bib
csl: elsevier-harvard.csl
---

# Introduction

`@Meyer2000` results in @Meyer2000.

`@Meyer2000 [p. 328]` results in @Meyer2000 [p. 328]

`[@Meyer2000]` results in [@Meyer2000]

`[-@Meyer2000]` results in [-@Meyer2000]

# Summary

# Reference

introduzca la descripción de la imagen aquí

Observe las diferencias en la salida del ejemplo "Especificar una bibliografía y citar autores"



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