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viridis - paletas amigables para la impresión y el color ciego

Viridis (que lleva el nombre de chromis viridis fish ) es un esquema de color desarrollado recientemente para la biblioteca de Python matplotlib (la presentación en video del enlace explica cómo se desarrolló el esquema de color y cuáles son sus principales ventajas). Está perfectamente portado a R

Hay 4 variantes de combinaciones de colores: magma , plasma , inferno y viridis (predeterminado). Se eligen con el parámetro de option y se codifican como A , B , C y D , de manera correspondiente. Para tener una impresión de los 4 esquemas de color, mire los mapas:

introduzca la descripción de la imagen aquí ( fuente de imagen )


El paquete se puede instalar desde CRAN o github .


La viñeta para el paquete viridis es simplemente brillante.


Una buena característica de la combinación de colores viridis es la integración con ggplot2 . Dentro del paquete se ggplot2 dos ggplot2 específicas de ggplot2 : scale_color_viridis() y scale_fill_viridis() . Vea el ejemplo a continuación:

library(viridis)
library(ggplot2)

gg1 <- ggplot(mtcars)+
    geom_point(aes(x = mpg, y = hp, color = disp), size = 3)+
    scale_color_viridis(option = "B")+
    theme_minimal()+
    theme(legend.position = c(.8,.8))

gg2 <- ggplot(mtcars)+
        geom_violin(aes(x = factor(cyl), y = hp, fill = factor(cyl)))+
        scale_fill_viridis(discrete = T)+
        theme_minimal()+
        theme(legend.position = 'none')

library(cowplot)
output <- plot_grid(gg1,gg2, labels = c('B','D'),label_size = 20)
print(output)

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RColorBrewer

El proyecto ColorBrewer es una herramienta muy popular para seleccionar paletas de colores que combinen armoniosamente. RColorBrewer es un puerto del proyecto para R y también ofrece paletas que no RColorBrewer .


Un ejemplo de uso

colors_vec <- brewer.pal(5, name = 'BrBG')
print(colors_vec)
[1] "#A6611A" "#DFC27D" "#F5F5F5" "#80CDC1" "#018571"

RColorBrewer crea opciones de coloración para ggplot2 : scale_color_brewer y scale_fill_brewer .

library(ggplot2)
ggplot(mtcars)+
        geom_point(aes(x = mpg, y = hp, color = factor(cyl)), size = 3)+
        scale_color_brewer(palette = 'Greens')+
        theme_minimal()+
        theme(legend.position = c(.8,.8))

introduzca la descripción de la imagen aquí

Una función práctica para vislumbrar un vector de colores.

Muy a menudo es necesario vislumbrar la paleta de colores elegida. Una solución elegante es la siguiente función autodefinida:

color_glimpse <- function(colors_string){
        n <- length(colors_string)
        hist(1:n,breaks=0:n,col=colors_string)
}

Un ejemplo de uso

color_glimpse(blues9)

camarada

espacio de color - interfaz de clic y arrastre para los colores

El colorspace paquete proporciona GUI para seleccionar una paleta. En la función choose_palette() , aparece la siguiente ventana emergente:

introduzca la descripción de la imagen aquí

Cuando se elige la paleta, simplemente presione OK y no olvide almacenar la salida en una variable, por ejemplo, pal .

pal <- choose_palette()

La salida es una función que toma n (número) como entrada y produce un vector de color de longitud n según la paleta seleccionada.

pal(10)
[1] "#023FA5" "#6371AF" "#959CC3" "#BEC1D4" "#DBDCE0" "#E0DBDC" "#D6BCC0" "#C6909A" "#AE5A6D" "#8E063B"

funciones básicas de color R

La función colors() enumera todos los nombres de colores reconocidos por R. Hay un buen PDF donde uno puede ver esos colores.


colorRampPalette crea una función que interpola un conjunto de colores dados para crear nuevas paletas de colores. Esta función de salida toma n (número) como entrada y produce un vector de color de longitud n interpola los colores iniciales.

pal <- colorRampPalette(c('white','red'))
pal(5)
[1] "#FFFFFF" "#FFBFBF" "#FF7F7F" "#FF3F3F" "#FF0000"

Cualquier color específico se puede producir con una función rgb() :

rgb(0,1,0)

Produce color green .

Paletas de colores ciegos

A pesar de que las personas que no conocen el color pueden reconocer una amplia gama de colores, puede ser difícil diferenciar entre ciertos colores.


RColorBrewer proporciona paletas de colores RColorBrewer :

library(RColorBrewer)
display.brewer.all(colorblindFriendly = T)

paleta de colores ciegos

El Color Universal Design de la Universidad de Tokio propone las siguientes paletas:

#palette using grey
cbPalette <- c("#999999", "#E69F00", "#56B4E9", "#009E73", "#F0E442", "#0072B2", "#D55E00", "#CC79A7")

#palette using black
cbbPalette <- c("#000000", "#E69F00", "#56B4E9", "#009E73", "#F0E442", "#0072B2", "#D55E00", "#CC79A7")


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