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Observaciones

A lo largo de los años, InnoDB ha mejorado hasta el punto de que casi siempre es mejor que MyISAM, al menos las versiones compatibles actualmente. En pocas palabras: no use MyISAM, excepto quizás para tablas que son verdaderamente temporales.

Una ventaja de MyISAM sobre InnoDB es que es 2x-3x más pequeño en el espacio requerido en el disco.

Cuando InnoDB salió por primera vez, MyISAM todavía era un motor viable. Pero con la llegada de XtraDB y 5.6, InnoDB se convirtió en "mejor" que MyISAM en la mayoría de los puntos de referencia.

Se rumorea que la próxima versión importante eliminará la necesidad de MyISAM al crear tablas realmente temporales de InnoDB y al mover las tablas del sistema a InnoDB.

MOTOR = MyISAM

CREATE TABLE foo (
     ...
) ENGINE=MyISAM;


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